Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ssxa1B1AUS7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ssxa1B1AUS7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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