Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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