Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Skint4A7TZF3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms