Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6880A3KG45 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms