Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CatsperbA2RTF1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatsperbA2RTF1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms