Protein–RNA interactions for Protein: A2ATJ4

Olfr1200, Olfactory receptor, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Olfr1200A2ATJ4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Olfr1200A2ATJ4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr1200A2ATJ4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms