Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms