Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbf1A2A870 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbf1A2A870 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms