Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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