Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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