Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ighv1-18A0A0A6YXN4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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