Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms