Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YVX8

Ighv5-2, Immunoglobulin heavy variable 5-2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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