Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP31Q70CQ4 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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