Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms