Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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