Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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TRAF1Q13077 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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TRAF1Q13077 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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TRAF1Q13077 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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TRAF1Q13077 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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TRAF1Q13077 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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TRAF1Q13077 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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TRAF1Q13077 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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TRAF1Q13077 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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TRAF1Q13077 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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TRAF1Q13077 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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