Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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SYCP1Q15431 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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