Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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