Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
APOBEC4Q8WW27 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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