Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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ZNF548Q8NEK5 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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