Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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VPS72Q15906 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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VPS72Q15906 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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VPS72Q15906 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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VPS72Q15906 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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VPS72Q15906 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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