Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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