Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ARID4AP29374 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ARID4AP29374 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ARID4AP29374 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ARID4AP29374 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ARID4AP29374 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ARID4AP29374 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ARID4AP29374 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ARID4AP29374 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ARID4AP29374 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ARID4AP29374 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ARID4AP29374 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms