Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms