Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms