Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a4Q9Z306 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a4Q9Z306 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms