Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria3Q9Z2W9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria3Q9Z2W9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms