Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms