Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Crlf3Q9Z2L7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms