Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H5

Epb41l1, Band 4.1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l1Q9Z2H5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41l1Q9Z2H5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41l1Q9Z2H5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms