Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd1Q9Z2E2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms