Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka4Q9Z2B9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms