Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldn6Q9Z262 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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