Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Lgr5Q9Z1P4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lgr5Q9Z1P4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms