Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms