Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shcbp1Q9Z179 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms