Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard6aQ9Z101 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard6aQ9Z101 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard6aQ9Z101 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard6aQ9Z101 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard6aQ9Z101 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard6aQ9Z101 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard6aQ9Z101 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard6aQ9Z101 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard6aQ9Z101 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard6aQ9Z101 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pard6aQ9Z101 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms