Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms