Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms