Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms