Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin2Q9WVE8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms