Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lemd3Q9WU40 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms