Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pfdn5Q9WU28 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pfdn5Q9WU28 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pfdn5Q9WU28 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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