Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms