Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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Usp18Q9WTV6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Usp18Q9WTV6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Usp18Q9WTV6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Usp18Q9WTV6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Usp18Q9WTV6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp18Q9WTV6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp18Q9WTV6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms