Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms