Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam50bQ9WTJ8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms