Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms