Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra1Q9R118 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms